'PD수첩 무죄' 판결에 대해 언론·시민단체는 "혼란스럽다", "납득할 수 없다"는 반응을 보였다. 시민과함께하는변호사들(시변·공동대표 이헌, 정주교)은 20일 "PD수첩 방송 내용이 허위 사실로 보기 어렵다는 법원의 판결을 이해할 수 없다"고 밝혔다.
시변은 "PD수첩은 공영방송으로서의 사명과 법적 의무를 망각하고 국가, 사회에 엄청난 손실을 초래하고도 진정한 사과를 하지 않았다"며 "검찰이 수사 결과 발표 당시 '적개심이 하늘을 찔러 광적으로 일했다'고 드러낸 바와 같이 PD수첩의 의도적인 허위·왜곡 방송은 새 정부에 저항하고 민영화를 반대하기 위한 정치적이고 이기적인 목적에서 이뤄졌다"고 비판했다.
이재교 공정언론시민연대 공동대표는 "재판부는 PD수첩의 전체 취지가 광우병의 위험성에 대한 경각심을 고취시키고 정부의 협상 과정을 비판하는 취지였다면 이번 판결의 정당성은 있을지 모른다"면서 "하지만 PD수첩의 메시지는 '미국 소는 미친 소'라는 것이었고, 이에 대한 증거가 없으니까 전혀 상관없는 왜곡된 영상과 인터뷰를 통해 무리한 논리를 몰고 간 것이 본질"이라고 말했다.
김강원 방송개혁시민연대 대표는 "법원의 판단대로라면 공영방송은 앞으로 공영성과 객관성이 없어도 된다는 것이냐"며 "오늘은 공영방송 사망 선고일"이라고 말했다.